孙传芳原来采取&ldo;坐山观虎斗&rdo;的态度，当北伐军进入湖北以后，孙传芳认为北伐军战线拉长，而吴佩孚又即将被打败，正是他收拾残局的时候，于是调集大军进入江西。

9月，江西便成为主要战场。

蒋介石指挥北伐军向赣西、赣北、赣南发起攻击，很快占领二十余地县及赣南重镇赣州。

但是，在进攻南昌时却遭到孙传芳部的顽强抵抗，蒋介石、白崇禧等亲临前线督战，从9月中旬起，连续进行了三次激烈的攻城战，直到11月8日才攻下南昌。

与此同时，留守粤东的第一军由何应钦指挥，向福建进军，一路上没有遭到多大的抵抗，于12月占领了福建省。

1927年1月，蒋介石等北伐军将领在南昌召开军事会议，决定将北伐部队编成东路军、中央军、西路军。

东路军总指挥为何应钦，前敌总指挥为白崇禧，主攻浙江和上海。

中央军总指挥由蒋介石兼任，下分江右军和江左军。

江右军总指挥为程潜，江左军总指挥为李宗仁，进攻安徽和南京。

西路军总指挥为唐生智，留守武汉并北上进攻河南。

由于孙传芳的部将夏超、陈仪、周凤岐等在浙江率部投靠北伐军，所以东路军很快于2月18日攻占杭州。

3月中旬，在上海工人武装起义的配合下，东路军进占上海。

3月24日，中央军之江右军攻克南京。

至此，孙传芳的主力所损过半，残部退往苏北地区。

3月26日，蒋介石到达上海，即与帝国主义、买办资产阶级密谋举行反革命政变。

其实在此之前，蒋介石已在南昌与帝国主义分子及江浙财团密谋反共反革命，下令枪杀了赣州总工会委员长、共产党员陈赞贤，以武力捣毁了南昌市、九江市、安徽省等国民党党部和总工会，提出将国民政府从武汉迁往南昌。

进入上海以后，蒋介石多次与李宗仁、白崇禧、李济深、吴稚晖、张静江等举行秘密会议，商谈反共清党问题。

在这时候，汪精卫也从国外返回上海。

4月3日，蒋介石、汪精卫、李宗仁、白崇禧、李济深、黄绍竑、张静江、吴稚晖、宋子文、蔡元培、李石曾、古应芬等十余人在上海举行了一次秘密会议。

会上，蒋介石等人力主马上实行反共清党，汪精卫虽同意反共，但在具体方法和时间上持异议，而主张于4月15日在南京召集国民党二届四中全会解决&ldo;党事纠纷&rdo;问题。

4月5日，汪精卫离开上海去武汉。

而蒋介石与李宗仁等则在龙华北代司令部召开会议，决定在上海清党。

英、美帝国主义、上海大资产阶级虞洽卿等，以及青红帮头子黄金荣、杜月笙、张啸林都表示支持配合蒋介石的&ldo;清党&rdo;。

4月9日，以白崇禧、周凤岐为正副司令的淞沪戒严司令部成立，并发布&ldo;战时戒严条例&rdo;十二条。